Hingga saat ini sistem pengelolaan sampah di beberapa daerah di Indonesia belum terselenggara dengan baik, misalnya di Pulau-Pulau Kecil. Kendala penyelenggaraan persampahan di pulau kecil adalah keterbatasan luas lahan untuk mengelola sampah dan pengangkutan sampah dari Pulau-Pulau Kecil ke Tempat Pemrosesan Akhir Sampah.